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专家构建黄麻基因组织特异表达数据库

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  近日,中国农业科学院麻类研究所种质资源团队在黄麻基因组织特异表达研究方面取得重要进展,通过比较转录组和基因网路共表达分析,充分挖掘在营养生长期和生殖生长期,黄麻根、茎皮、叶、花和果实中特异表达的基因和显著相关的表达模块,成功构建了黄麻基因组织表达数据库,为黄麻功能基因挖掘奠定基础。相关研究成果在线发表在《BMC基因组学(BMC Genomics)》和《工业作物和产品(Industrial Crops & Products)》上。

  据杨泽茂副研究员介绍,黄麻是世界上种植面积和产量最大的韧皮纤维作物。近年来,黄麻除了用作纤维,在药用、食用、环保型材料等多用途利用方面的研究也不断深入。黄麻基因组织表达数据库的建立为改良黄麻各组织经济价值提供了基因数据资源。基于黄麻基因组织表达数据库,研究人员在茎皮中成功挖掘到一个控制纤维发育的调控网络,该网络由22个基因组成,其中一个转录因子起到核心调控作用。在花器官中,发现黄酮类合成代谢通路高度富集,多数基因表达上调。

  该研究得到中国农科院科技创新工程、国家自然科学基金及湖南省自然科学基金等项目资助。(通讯员 廖勇凤)

  原文链接:

  (1)http://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.112101

  (2)http://doi.org/10.1186/s12864-020-06805-6

  

  黄麻基因共表达网络

  

  茎皮中转录因子OMO55970.1调控的纤维发育相关基因网络

  

  黄麻花器官中黄酮类合成代谢通路和基因表达

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